大部分抽动症在早期主要表现为频繁眨眼，需要与眼疲劳、结膜炎等鉴别，通常推荐先到眼科就诊完善检查。也有不少患者表现为吸鼻子/耸鼻子，看起来像是鼻子不舒服，常需要到耳鼻咽喉科就诊，鉴别是否有过敏性鼻炎、腺样体肥大等问题。以清嗓子、嗯嗯声或咳嗽为表现的孩子，则需要鉴别慢性咽炎、慢性咳嗽等呼吸道疾病。当症状反复出现，而经过相关专科医生评估后未查找出原因，或相继出现上述多种症状者，则需要高度怀疑抽动症的可能，建议转至神经内科或精神心理科就诊。