不能。

孤独症是一种复杂的大脑发育疾病。而且，孤独症患者并没有特别的脑结构改变。

孤独症儿童可能在大脑结构和功能上与普通儿童有差异，如2-4岁孤独症幼儿童的头围，可能比正常发育儿童的大。

但这些脑结构和功能的改变，通常是非特异性的。

因此，不能通过一般的大脑磁共振和CT检查，来判断孩子是否有孤独症。